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Space X成功将四名平民送到轨道&科学家现在能在几分钟内通过PC组装出完整基因组

Space X成功将四名平民送到轨道

Space X 成功将四名乘员全部由平民组成的 Inspiration4 飞船发射到地球轨道。SpaceX 是在今年初宣布了首次纯商业载人太空任务,Shift4 Payments 创始人兼 CEO Jared Isaacman 支付了 4 个座位,除他之外另外三个座位的人选从公众中间挑选出来,四名乘员全部是平民:Isaacman;骨癌幸存者、29 岁的圣裘德儿童研究医院医生助理 Hayley Arceneaux;51 岁的地质学家、社区学院教师 Sian Proctor 博士;42 岁的洛克希德马丁公司雇员 Chris Sembroski。其中 Hayley Arceneaux 是最年轻的太空游客,也是第一名带假肢进入太空的人类。他们将在太空中度过三天。

科学家现在能在几分钟内通过PC组装出完整基因组

研究人员开发出一项新技术,能在 PC 上重建包括人类基因组在内的全基因组组装。这项研究发表在 9 月 14 日的《Cell Systems》杂志上,其灵感来自由单词而非字母为语言模型所实现的浓缩构建单元方式,找到了一种更为紧凑的基因组数据表达途径。为了比现有技术更高效地完成基因组排列,研究人员转向语言模型,希望超越以往在所有可能的计数对之间进行成对比较的“笨”办法。研究人员基于 de Bruijn 图(一种用于基因组排列的简单、高效数据结构)概念开发出一种极小空间 de Bruijn图(mdBG),其使用被称为极小值的短核苷酸序列来代替单核苷酸。一位研究人员称,“我们的极小空间 de Bruijn 图只需要存储总核苷酸中的一小部分,同时保留整个基因组结构,因此能够获得远高于经典de Bruijn图的存放效率。” 研究人员利用这种方法为黑腹果蝇排列出了高精度HiFi数据(具有几乎完美的单分子读取精度),同时成功还原出由 Pacific Biosciences(PacBio)提供的人类基因组数据。在评估所生成的基因组时,研究人员发现基于 mdBG 软件进行基因组组装的时间消耗仅为其他组装方案的三十三分之一,所占用的随机存取存储器(RAM)硬件容量则为八分之一。他们的软件在进行 HiFI 人类数据执行基因组组装时速度可达 Peregrine 组装程序的 81 倍,内存占用量则仅为十八分之一;与 hifiasm 组装程序相比快 338 倍,内存占用量为十九分之一。接下来,研究人员又使用这种新方法为 661406 个细菌基因组的集合构建起一份索引,这也是迄今为止同类基因组的最大集合。他们发现,这项新技术能够在 13 分钟之内完成对整个集合内抗菌素抗性基因的搜索操作,而传统标准序列比对则需要 7 个小时。
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文章名称:《Space X成功将四名平民送到轨道&科学家现在能在几分钟内通过PC组装出完整基因组》
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